Vaikų darželis „Vyturėlis“ bendradarbiauja su šiais socialiniais partneriais:
° Joniškio rajono ikimokyklinėmis įstaigomis.
° Radviliškio vaikų lopšeliais – darželiais „Eglutė“, „Kregždutė“;
° Šiaulių miesto vaikų lopšeliu – darželiu „Žiogelis“;
° Šilutės vaikų lopšeliu – darželiu „Raudonkepuraitė“;
° Pakruojo vaikų lopšeliu – darželiu „Vyturėlis“;
° Šiaulių Rėkyvos progimnazija;
° Tauragės vaikų reabilitacijos centras-mokykla „Pušelė“
Joniškio miesto mokyklomis:
° Mato Slančiausko progimnazija;
° „Saulės“ pagrindine mokykla.
Medicinos įstaigomis:
° Joniškio PSPC, UAB „Saulenė“;
° I Į Šeimos sveikatos centru.
° Joniškio rajono švietimo centru.
° Joniškio sporto centru.
° Joniškio kultūros centru.
° Joniškio visuomenės ir sveikatos biuru.
2014 m. pasirašyta bendradarbiavimo sutartis su Latvijos Respublikos Aucės priešmokyklinio ugdymo įstaiga „Piladzitis“.
2024 m. pasirašyta partnerystės tinklo bendradarbiavimo sutartis su Lietuvos ikimokyklinio ugdymo įstaigomis „Vyturėlis“.